Ο πατέρας του Μανασσή είναι ο βασιλιάς Εζεκίας, ευσεβής. Ακούει ευλαβικά τον συγγενή του (θείο ή ξάδερφο), τον προφήτη Ησαΐα, και ο Κύριος δίνει στον βασιλιά ζωντανές αποδείξεις για τη δύναμή Του, τόσο στην προσωπική ζωή του βασιλιά όσο και στην τύχη του κράτους του, όπως είδαμε.
Φαίνεται ότι θα μπορούσε κανείς να ελπίζει ότι ο Μανασσής, ο γιος ενός ευσεβούς πατέρα, θα κληρονομούσε την ευσέβειά του και θα συνέχιζε το έργο του πατέρα του. Αυτό όμως δεν συνέβη. Η μητέρα του Μανασσή ήταν μια Φοινίκισσα πριγκίπισσα που ονομαζόταν Εφσιβά, που σημαίνει «η χαρά μου είναι σε αυτήν». Έτσι με αγάπη ονομάστηκε από τον σύζυγό της, τον βασιλέα Εζεκία, όταν αυτός, σε μεγάλη ηλικία, αφού ο Κύριος εισήκουσε τις προσευχές του και του έδωσε άλλα 15 χρόνια ζωής, παντρεύτηκε μια νεαρή και, πιθανώς, μια όμορφη Φοινίκισσα.
Η επιρροή της Φοινίκισσας μητέρας στον Μανασσή αποδείχθηκε εξαιρετικά ολέθρια. «Ο Μανασσής ήταν δώδεκα ετών όταν βασίλευσε και βασίλεψε 55 χρόνια στην Ιερουσαλήμ. Και έκανε το κακό ενώπιον του Κυρίου, μιμούμενος τα βδελύγματα των λαών, τους οποίους ο Κύριος έδιωξε από την παρουσία των υιών του Ισραήλ. Έβαλε τον Βάαλ στον οίκο του Κυρίου, και έχτισε θυσιαστήρια στα φώτα του ουρανού και στις δύο αυλές του Κυρίου».
Η σημασία αυτών των πράξεων του Μανασσή επιδεινώνεται από το γεγονός ότι ο ναός του Θεού στην Ιερουσαλήμ ήταν εκείνη την εποχή ο μόνος ναός του Αληθινού Θεού σε ολόκληρο τον κόσμο, ενώ ολόκληρη η γη ήταν γεμάτη ειδωλολατρικούς ναούς. Κι έτσι, ο Μανασσής δεν λυπάται αυτόν τον μοναδικό ναό του Κυρίου, αλλά τον γεμίζει με φοινικική αηδία. Οι Εβραίοι, που παρέμειναν πιστοί στον Κύριο, ήταν ιδιαίτερα αγανακτισμένοι επειδή ο Μανασσής «τοποθέτησε την εικόνα της Αστάρτης και τα είδωλά της στο ναό του Θεού».
Λέγεται πως κατά τους χρόνους της βασιλείας του Μανασσή (687-642), ο όποιος ξεπέρασε όλους τους προκατόχους του σέ ασέβεια και σκληρότητα, χωρίς να χαριστεί ούτε καν στους προφήτες που του υπενθύμιζαν τον Νόμο του Θεού, ο Ησαΐας κόπηκε στά δύο με ξύλινο πριόνι.
Εκείνη την περίοδο ο Σαμασούκιν, αδερφός του βασιλέως της Ασσυρίας Ασσουρμπανιπάλ, κυβερνήτου της Βαβυλώνας, επαναστάτησε εναντίον του αδελφού του, βασιλέως των Ασσυρίων, και κάλεσε τον Μανασσή να τον βοηθήσει να πάρει αυτός την εξουσία. Ο Μανασσής συμφώνησε, αλλά δεν πήγε να τον βοηθήσει αμέσως. Εν τω μεταξύ, ο Ασσουμπανιπάλ πήγε στη Βαβυλώνα και νίκησε τον Σαμασούκιν και κατόπιν, μαθαίνοντας ότι ο Μανασσής ήταν να τον βοηθήσει, τον κάλεσε να του δώσει εξηγήσεις για την πράξη του να επαναστατήσει εναντίον του.
Μαθαίνοντας ότι ο βασιλιάς των Ασσυρίων, θα ‘ρθεί να συλλάβει τον ίδιο και να καταστρέψει την Ιουδαία, αν δεν πήγαινε, αποφάσισε να παραδοθεί και να μην αντισταθεί. Οι στρατιώτες όμως του βασιλέως των Ασσυρίων, τον αλυσόδεσαν και τον πήγαν αλυσοδεμένο ενώπιον του βασιλέως των. Σε αυτή την αιχμαλωσία, ο Μανασσής πέρασε αρκετά χρόνια, πόσα δεν γνωρίζουμε ακριβώς, αλλά όχι λιγότερα από πέντε χρόνια.
Η Αγία Γραφή λέει: «Στη στενοχώρια του άρχισε να προσεύχεται στον Κύριο τον Θεό του και ταπεινώθηκε βαθιά μπροστά στον Θεό των πατέρων του. Και προσευχήθηκε σε αυτόν, και ο Θεός ενέσκυψε σε αυτόν και άκουσε την προσευχή του και τον έφερε πίσω στην Ιερουσαλήμ.» Την προσευχή που έκανε τότε την διαβάζουμε εμείς σήμερα στην ακολουθία του Μεγάλου Αποδείπνου.
Από πολλές ιστορικές πηγές που λένε για εκείνες τις εποχές, γνωρίζουμε για δεκάδες και εκατοντάδες χιλιάδες αιχμαλώτους που υπέφεραν στην πιο σκληρή ασσυριακή αιχμαλωσία. Λίγοι άνθρωποι, ακόμη και στην ειδωλολατρική αρχαιότητα, είχαν τέτοια ακόρεστη δίψα για βασανιστήρια και φόνο. «Είναι στην καρδιά του να καταστρέψει και να καταστρέψει πολλά έθνη», λέει ο προφήτης Ησαΐας για την Ασσυρία. Αποκαλεί τους Ασσύριους «έναν άγριο λαό» και ο Αγ. ο προφήτης Ναούμ αποκαλεί την πρωτεύουσα της Ασσυρίας Νινευή «την πόλη του αίματος, είναι γεμάτη δόλο και φόνο».
Και πολλές περήφανες και άγριες δηλώσεις των Ασσύριων βασιλιάδων έχουν φτάσει σε εμάς για το πόσες χώρες κατέστρεψαν, πόσες πόλεις κατέστρεψαν, πόσους ανθρώπους σκότωσαν, τύφλωσαν και αιχμαλώτισαν. Καμαρώνουν για τη σκληρότητά τους, την σκληρότητά τους, την απανθρωπιά τους.
Επιστρέφοντας στην Ιερουσαλήμ, ο Μανασσής έκανε ό,τι μπορούσε για να επανορθώσει για το λάθος που είχε κάνει. «Και ο Μανασσής ήξερε ότι ο Κύριος είναι Θεός… Και εξεδίωξε τους ξένους θεούς και τα είδωλα από τον οίκο του Κυρίου, και όλους τους ναούς που έχτισε στο βουνό του Κυρίου και στην Ιερουσαλήμ, τους πέταξε έξω από το πόλη. Και αποκατέστησε το θυσιαστήριο του Κυρίου και πρόσφερε πάνω του ειρηνικές προσφορές και επαινετικά, και είπε στους Ιουδαίους να υπηρετήσουν τον Κύριο τον Θεό του Ισραήλ»
